Hay una isla en Oriente conocida como "Japón". Este pequeño país ha sido amenazado por la superpotencia del Imperio de Britannia. Y hay dos niños viviendo ahí. Uno es el hijo del emperador del Sacro Imperio de Britannia —Lelouch vi Britannia. Su madre fue asesinada y Lelouch fue enviado a Japón como una herramienta política. El otro niño es el hijo del Primer Ministro de Japón —Suzaku Kururugi. ¡Su reunión será el preludio a una guerra que involucra a todo el mundo!