Tras la exitosa conquista de la Puerta por parte de la humanidad, la paz ha vuelto una vez más. Sin embargo, las poderosas habilidades psíquicas de los Espers se han convertido en un arma de doble filo para la humanidad, causándoles una gran angustia. Surge una nueva oportunidad para el Esper "NO.00 Michael", que se enfrenta a una muerte inminente. Adam, un soldado retirado que siempre ha luchado con la relación entre Guías y Espers, decide dar una segunda oportunidad a Michael, el causante de su lesión en la pierna. Adam le da a Michael un nuevo nombre, "Eva", con la esperanza de que pueda llevar una vida normal, mezclándose con la humanidad. Los dos, que siempre han luchado en el frente, arriesgando sus vidas, se embarcan en un viaje para vivir una vida pacífica en el abrazo de la humanidad, soñando con una existencia ordinaria.