Durante el Periodo Edo, había un rumor por todo el camino Nakasendou de cierto monstruo llamado «Mononote». Okota, una chica viajera, conoce a Hitatsura, un chico con unas extrañas «manos cambiadas». Realizan trabajos diarios de ninja durante los tiempos de paz. Conoce el arduo y magnífico mundo de los trabajos de ninja de Edo.