En Ciudad Academia , hay un concurso popular de próxima generación. En realidad, esta es una batalla mano a mano entre gigantes Virtuaroids que aparecen en las calles. Se llama formalmente como "Máquina de guerra computarizada Virtual-On". Como se puede argumentar que el Nivel 5 y el Nivel 0 son iguales dada la técnica, se ha extendido con fuerza explosiva entre los estudiantes de Ciudad Academia. Un día, Index con su blanco Bal Bados, combate contra Touma con su Temjin. "Soy Ririn. Furashina Ririn . No soy Ririna ... Munya ..." Una niña aparentemente insomne ​​llega a Ciudad Academia. Y, Kamijou tiene un encuentro. El Virtual-On habitual se encuentra con un inevitable accidente sin precedentes. Es decir, las Máquinas de guerra computarizadas se fusionan con Ciudad Academia, ¡un signo de una gran batalla a punto de suceder! ¡Misaka Mikoto y su Raiden, Shokuhou Misaki y su Angelan, así como muchos otros harán apariciones!